Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18528 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18528 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18528 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18528 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18528 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P18528 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
P18528 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms