Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsdP18242 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms