Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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