Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ass1P16460 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ass1P16460 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms