Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms