Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf1P15314 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms