Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Q9P14431 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms