Protein–RNA interactions for Protein: P14220

Gypa, Glycophorin-A, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypaP14220 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypaP14220 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GypaP14220 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GypaP14220 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GypaP14220 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GypaP14220 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GypaP14220 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GypaP14220 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GypaP14220 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GypaP14220 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypaP14220 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypaP14220 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms