Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb1P13372 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms