Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrm1P12657 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrm1P12657 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms