Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtcP11725 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtcP11725 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtcP11725 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtcP11725 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OtcP11725 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OtcP11725 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OtcP11725 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtcP11725 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtcP11725 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtcP11725 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms