Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
DmdP11531 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DmdP11531 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DmdP11531 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DmdP11531 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DmdP11531 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms