Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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