Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms