Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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