Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa9P09631 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms