Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NefmP08553 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefmP08553 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefmP08553 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefmP08553 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefmP08553 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefmP08553 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefmP08553 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefmP08553 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefmP08553 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefmP08553 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefmP08553 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefmP08553 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefmP08553 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefmP08553 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NefmP08553 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NefmP08553 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NefmP08553 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NefmP08553 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefmP08553 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefmP08553 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefmP08553 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NefmP08553 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefmP08553 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefmP08553 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefmP08553 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefmP08553 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefmP08553 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefmP08553 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefmP08553 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefmP08553 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefmP08553 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefmP08553 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms