Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ApoeP08226 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms