Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Egr1P08046 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr1P08046 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms