Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtrP07309 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TtrP07309 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TtrP07309 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TtrP07309 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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