Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfrbP05622 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfrbP05622 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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