Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ItgamP05555 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgamP05555 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms