Protein–RNA interactions for Protein: P05214

Tuba3a, Tubulin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba3aP05214 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba3aP05214 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms