Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms