Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04224 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04224 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04224 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04224 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04224 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04224 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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P04224 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04224 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04224 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04224 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04224 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04224 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04224 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04224 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04224 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04224 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04224 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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