Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04213 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04213 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04213 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04213 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04213 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04213 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04213 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04213 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04213 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms