Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04212 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04212 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04212 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms