Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HbaP01942 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HbaP01942 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HbaP01942 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HbaP01942 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms