Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01669 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01669 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01669 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01669 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms