Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01667 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01667 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01667 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01667 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01667 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms