Protein–RNA interactions for Protein: P01027

C3, Complement C3, mousemouse

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3P01027 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3P01027 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C3P01027 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3P01027 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3P01027 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3P01027 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3P01027 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3P01027 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3P01027 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3P01027 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3P01027 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C3P01027 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3P01027 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3P01027 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3P01027 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3P01027 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3P01027 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3P01027 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3P01027 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3P01027 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3P01027 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3P01027 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C3P01027 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3P01027 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3P01027 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3P01027 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3P01027 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3P01027 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms