Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccl20O89093 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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