Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3pxd2aO89032 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3pxd2aO89032 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3pxd2aO89032 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3pxd2aO89032 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3pxd2aO89032 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3pxd2aO89032 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms