Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcn2O88968 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms