Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apaf1O88879 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms