Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CcnkO88874 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CcnkO88874 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CcnkO88874 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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