Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BlmO88700 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BlmO88700 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BlmO88700 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BlmO88700 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BlmO88700 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BlmO88700 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BlmO88700 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BlmO88700 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BlmO88700 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BlmO88700 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BlmO88700 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BlmO88700 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BlmO88700 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BlmO88700 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms