Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3aO88508 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms