Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CntfrO88507 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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