Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcnk4O88454 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnk4O88454 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms