Protein–RNA interactions for Protein: O88245

Gm10139, Mszf85 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10139O88245 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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