Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col5a1O88207 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Col5a1O88207 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Col5a1O88207 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Col5a1O88207 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Col5a1O88207 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Col5a1O88207 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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