Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms