Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb5O70309 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms