Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxq1O70220 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxq1O70220 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxq1O70220 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxq1O70220 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxq1O70220 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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