Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms