Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alx3O70137 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alx3O70137 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms