Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms