Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad51dO55230 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms