Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tlx3O55144 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tlx3O55144 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tlx3O55144 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms